Základní škola Bernarda Bolzana o. p. s zahájla svoji činnost 1. září 1997 otevřením dvou prvních a jedné třetí třídy. Škola byla zřízena na základě doporučení ministra školství České republiky pod záštitou bavorského ministra školství, vědy a kultury. Zakladatelkou a ředitelkou školy se stala Mgr. Marie Berková.
Slavnostního zahájení činnosti školy se zúčastnil ministr školství, mládeže a tělovýchovy ČR pan Jiří Gruša, velvyslanec SRN v ČR pan Anton Rossbach, zástupce bavorského ministra školství, vědy a kultury a celá řada významných osobností z kulturní a hospodářské oblasti. Škola nese čestné jméno Bernarda Bolzana. Jméno tohoto katolického kněze, filozofa, vědce a pedagoga je pro naši činnost velkým závazkem a současně nejlépe vyjadřuje poslání naší školy.V souladu s novými zákony upravující činnost neziskového sektoru byla původní nadace změněna na obecně prospěšnou společnost.